Setelah berhasil lolos ujian masuk, Sakuta Azusagawa akhirnya diterima di universitas yang sama dengan pacarnya, Mai Sakurajima. Ia perlahan-lahan mulai terbiasa dengan lingkungan baru tersebut sambil menghadiri acara-acara mahasiswa dan berkenalan dengan teman-teman baru. Segala sesuatunya tampak berjalan lancar hingga teman Sakuta dan anggota grup idola Sweet Bullet, Uzuki Hirokawa, mulai bertingkah aneh. Dengan anggota Sweet Bullet lainnya, Nodoka Toyohama, memohon bantuannya, Sakuta menyadari bahwa ia telah terjebak dalam kasus lain dari Sindrom Pubertas yang misterius—Uzuki merasa tertekan oleh lonjakan popularitas mendadak dan rumor tentang kemungkinan karier solo. Sementara Sakuta mencari solusi, kasus lain dari Sindrom Pubertas perlahan-lahan muncul dari bayang-bayang.